SnapGene破解版是一款專業(yè)的分子生物學(xué)軟件,這款軟件為用戶提供了強大的工具和功能,使用戶可以更加便捷的處理,分析和模擬DNA序列信息,還能支持導(dǎo)入已有的DNA序列數(shù)據(jù)并進行進一步的研究和分析,從而為用戶節(jié)省實驗時間和成本,有需要的小伙伴就快來下載體驗吧。

SnapGene常用功能

1.1 質(zhì)粒圖譜

以pUC57質(zhì)粒為例，怎樣畫出其質(zhì)粒圖譜呢?

首先我們在NCBI上下載pUC57的FASTA序列。打開SnapGene，選擇第一個功能New DNA File，將序列粘貼進去后，點擊【OK】。(這里由于是環(huán)狀質(zhì)粒，所以選擇了默認的Circular)軟件自動識別除了9個通用的元件，包括氨芐抗性基因(AmpR)、lac操縱子、復(fù)制起點(ori)等，點擊【Add 9 features】，進入SnapGene的主界面。

進入主界面后，可以看到上面一排是工具欄，下面是幾個界面，對應(yīng)的功能如下：

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1.2 質(zhì)粒圖譜的具體編輯方法

(1)序列標注

由于之前打開序列文件的時候，軟件自動識別出了9個常見的元件，所以也同時自動生成了載體圖譜。而當(dāng)我們點擊Sequece界面時，也可以看到相應(yīng)的元件已經(jīng)標注在序列上了。

當(dāng)然我們也可以自己編輯，雙擊lacZa的文字即可進入feature編輯界面，可以編輯序列名稱、方向、范圍以及顏色等信息，編輯完成后點【OK】，Sequence界面就會出現(xiàn)相應(yīng)的序列注釋信息。

如果我們要新添加一段序列注釋，則選擇相應(yīng)序列，點擊工具欄【Features】—【Addfeature】，同樣會進入Feature編輯界面。

(2)設(shè)計引物

我們可以直接在序列上添加引物，當(dāng)我們選中一段序列后，軟件會直接給出序列長度和Tm值，可以據(jù)此調(diào)整引物序列。

點擊工具欄中的【Primers】—【Add primers】，進入引物編輯界面，可設(shè)計正向或者反向引物，編輯好引物名稱后點擊【Add Primers to Template】，即可在Sequence界面看到編輯好的引物序列。

(3)圖譜導(dǎo)出

單擊工具欄【File】—【Export】—【Map】，即可導(dǎo)出質(zhì)粒圖譜，支持多種格式，包括常見的圖片格式TIFF、PNG等，也可以生成PDF文檔。

2 序列對比

序列比對的軟件有很多，SnapGene用于序列比對的優(yōu)勢在于其序列是雙向的，比對時不用考慮序列方向問題。

操作也比較簡單，左側(cè)工具條最下方的按鈕就是序列比對，點擊后導(dǎo)入需要比對的序列即可。比對結(jié)果中比對不上的地方用紅色標注。

另外SnapGene也支持測序文件導(dǎo)入(.abi文件)，例如我們先打開一個參考序列，再通過序列比對按鈕將需要比對的測序文件都打開，就能獲得多序列比對的結(jié)果，點擊左側(cè)序列則能直接查看峰圖，非常方便。

SnapGene軟件特色

1、為學(xué)生，博士后和技術(shù)人員帶來的好處

工作更快，更聰明

SnapGene 使您的 DNA 操作易于可視化和模擬，并在錯誤發(fā)生之前提醒您。

保持記錄不費吹灰之力

SnapGene 中的每個 DNA 操作都會自動記錄，因此您可以準確地看到您所做的操作并檢索祖先結(jié)構(gòu)的序列。

隨時隨地學(xué)習(xí)

如果您不熟悉克隆或特定技術(shù)，豐富直觀的 SnapGene 界面可幫助您了解其工作原理。

輕松與世界各地的同事共享數(shù)據(jù)

SnapGene 的 .dna 文件可以通過免費的跨平臺 SnapGene Viewer 打開，使您能夠與同事共享豐富的帶注釋的地圖和序列。

2、PI 和實驗室管理器的好處

更快地獲得結(jié)果

實驗室中的人員將不再使用有缺陷的克隆程序浪費時間，并將在第一時間開始獲得正確的構(gòu)造。

花更少的時間教人們?nèi)绾慰寺?/p>

SnapGene 是一個很好的教學(xué)工具，甚至新手克隆人也會很快學(xué)會如何自己解決問題。

存錢

即使是有經(jīng)驗的科學(xué)家也會犯錯 通常，至少 10% 的程序由于計劃錯誤而失敗，從而導(dǎo)致浪費時間和材料。使用 SnapGene 可以防止這些損失，SnapGene 將多次收回成本。

保持更好的實驗室記錄

SnapGene 自動生成每個序列編輯和克隆過程的記錄，因此即使在實驗室成員離開后，您也不會忘記構(gòu)造的構(gòu)建方式。

3、IT 部門的好處

您可以在整個站點范圍內(nèi)實施我們靈活的許可選項，也可以從小規(guī)模開始實施，并以可訪問的價格增長。

4、對行業(yè)的好處

操作快點

借助 SnapGene 直觀的用戶體驗，強大的可視化和仿真工具以及錯誤預(yù)防功能，您公司的研發(fā)工作將更快地進行。

保持記錄不費吹灰之力

SnapGene 自動生成每個序列編輯和克隆過程的豐富圖形歷史記錄，因此您永遠不會忘記構(gòu)造的構(gòu)建方式。

獲得您現(xiàn)在和將來所需的功能

SnapGene 正在積極開發(fā)中，由工作科學(xué)家設(shè)計。我們不斷發(fā)布新功能和增強功能，并根據(jù)客戶反饋確定優(yōu)先級。

擁有您的數(shù)據(jù)并保護您的 IP

SnapGene 不會將您鎖定到特定的文件格式或數(shù)據(jù)存儲位置，因此您始終可以控制數(shù)據(jù)。桌面許可方法可確保您的數(shù)據(jù)在公司防火墻和公司硬件之后的安全。

無縫實施

SnapGene 支持大量文件格式。因此，您的科學(xué)家可以完全切換到 SnapGene 而不會丟失數(shù)據(jù)，或者可以繼續(xù)使用遺留軟件和 SnapGene 而不會發(fā)生沖突。

SnapGene功能介紹

1、In-Fusion 克隆

Clontech 的 In-Fusion 克隆技術(shù)是創(chuàng)建無縫基因融合的一種非常通用的方法。 SnapGene 是第一個模擬此程序的軟件。 只需選擇您想要融合的 DNA 片段，SnapGene 即可設(shè)計引物。

2、Gibson Assembly

許多研究人員轉(zhuǎn)向 Gibson 組裝，在不使用限制性酶的情況下將片段插入質(zhì)粒中。待連接的 DNA 片段通過 PCR 擴增以產(chǎn)生重疊的末端。SnapGene 簡化了Gibson組裝反應(yīng)的計劃，并自動化了引物設(shè)計。

3、限制性克隆

SnapGene 獨特的限制克隆界面以干凈的布局顯示您需要的信息。克隆程序的規(guī)劃從來沒有這么簡單過。如果你已經(jīng)知道你想做什么，克隆模擬只需要幾秒鐘。如果克隆過程存在設(shè)計缺陷，則可以在模擬過程中捕獲并糾正錯誤。

4、聚合酶鏈反應(yīng)與誘變

設(shè)計引物后，它們可以用來模擬常規(guī) PCR、重疊延伸 PCR 或誘變。得到的DNA序列文件可立即用于進一步操作。與限制克隆界面一樣，以引物為中心的界面以直觀的方式顯示關(guān)鍵信息。

5、自動保存

SnapGene 最令人驚訝的是它自動記錄了克隆項目中的步驟。每次編輯序列或模擬克隆、PCR 或誘變時，程序都會自動記錄在圖形歷史中。在模擬 DNA 構(gòu)建體的創(chuàng)建之后，您可以使用歷史作為實驗方案。

6、瓊脂糖凝膠電泳

napGene 使用一種先進的算法來創(chuàng)建真實的瓊脂糖凝膠模擬。限制性片段以三種形式顯示:模擬凝膠、數(shù)值列表和序列圖。您可以使用模擬凝膠計劃診斷限制摘要，或?qū)嶋H凝膠圖像與預(yù)測模式進行比較。

7、酶位點

SnapGene 以清晰的方式突出限制位點，自動標記甲基化阻斷的位點。簡單的控制可以讓你選擇有用的酶組，比如“獨特的切割器”，或者定義自定義酶組和首選供應(yīng)商。信息工具提示提供關(guān)鍵數(shù)據(jù)。“限制酶”窗口顯示了數(shù)百種商用酶的詳細特性。