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Geneious Prime 2021

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Geneious Prime 2021 v2021.1.1激活版

分子生物學(xué)和NGS分析工具
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軟件標(biāo)簽:
Geneious Prime是一款功能全面且易用的生物信息學(xué)軟件,可用于分析DNA、RNA和蛋白質(zhì)序列,進(jìn)行序列比對、物種鑒定、基因組組裝、SNP分析和分子進(jìn)化分析等多種生物信息學(xué)應(yīng)用。Geneious Prime支持多種常用數(shù)據(jù)格式,包括FASTA、FASTQ、GenBank和EMBL等,可以和NCBI、BLAST和GeneBank等公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行無縫集成,快速獲取生物信息。Geneious Prime的功能強(qiáng)大,用戶可使用自己的數(shù)據(jù)或公共數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)進(jìn)行定量分析,不同級別的用戶可以根據(jù)自己的需要使用不同的版本。此外,Geneious Prime還提供了豐富的圖形界面和可定制選項(xiàng),可自定義工作流程,提高生物信息學(xué)分析的效率和準(zhǔn)確性。Geneious Prime是一款功能齊全、易用性高的生物信息學(xué)工具,為生物學(xué)家和生物技術(shù)研究人員提供了完美的分析平臺,幫助他們更好地理解和研究生物世界。KKX小編給大家分享的Geneious Prime 2021自帶激活補(bǔ)丁,喜歡的朋友不要錯(cuò)過了哦!

Geneious的解決方案

1、領(lǐng)先的解決方案
廣泛的解決方案在世界范圍內(nèi)使用。小型生物技術(shù)初創(chuàng)企業(yè),大型制藥組織,學(xué)術(shù)團(tuán)體以及介于兩者之間的每個(gè)人都使用Geneious優(yōu)化序列數(shù)據(jù)管理,鼓勵(lì)一致性和協(xié)作性并加上快速分析速度。
2、生物制藥藥物發(fā)現(xiàn)
從事治療抗體研發(fā)的企業(yè)正在選擇Geneious Biologics,以快速,準(zhǔn)確地探查大量抗體序列信息,以縮小對成功候選者的搜索范圍并進(jìn)行更快的創(chuàng)新。
如何運(yùn)作:Geneious Biologics與Geneious Prime完全相互操作。無縫的云集成使用戶可以將序列數(shù)據(jù)從Geneious Biologics實(shí)時(shí)傳輸?shù)紾eneious Prime,反之亦然,從而簡化了用于下游處理的NGS抗體的傳輸。
盡量減少在應(yīng)用程序之間導(dǎo)出NGS和化驗(yàn)數(shù)據(jù)的需要,消除了重大的數(shù)據(jù)管理挑戰(zhàn),并降低了數(shù)據(jù)丟失風(fēng)險(xiǎn)。在Geneious Biologics云平臺上管理的工作流是可記錄和可溯源的,從而簡化了整個(gè)藥物返現(xiàn)過程中抗體NGS數(shù)據(jù)流。在云中整合抗體研究數(shù)據(jù)還可以減緩信息的可追溯性,這是保護(hù)關(guān)鍵IP的重要考慮因素。
3、商業(yè)生命科學(xué)
在制藥,診斷和農(nóng)業(yè)科學(xué)等眾多領(lǐng)域工作的組織使用Geneious Prime來提高團(tuán)隊(duì)的效率并釋放序列數(shù)據(jù)的價(jià)值。
如何運(yùn)作:Geneious Prime出色的互操作性,包括API,插件開發(fā)和創(chuàng)建工作流的能力,意味著科學(xué)可以更快地完成。集中化程序列數(shù)據(jù)管理和分析可減少團(tuán)隊(duì)之間的混亂,并最大程度地提高寫作的收益。
Geneious Prime提供了市場最廣泛的分析工具。輕松的分子克隆應(yīng)用程序是隨行業(yè)趨勢而更新的,并且諸如組裝,比對和BLAST搜索之類的工具在一個(gè)全面的套件中都可用。用戶可以迅速掌握Geneious Prime的直觀設(shè)計(jì),從而減少了訓(xùn)練團(tuán)隊(duì)所需的時(shí)間。
4、學(xué)術(shù)與政府研究
學(xué)生,學(xué)者和政府專業(yè)人員可以控制他們的序列數(shù)據(jù)并發(fā)現(xiàn)有價(jià)值的見解。Geneious Prime在賦予科學(xué)力量方面的聲譽(yù)使其成功為世界上被引用次數(shù)最多的序列分析和管理關(guān)鍵。
如何運(yùn)行:由于其運(yùn)行的全面性,Geneious Prime在眾多研究學(xué)科中扮演著不可或缺的角色。可以簡單地導(dǎo)入或轉(zhuǎn)換包括NGS在內(nèi)的各種數(shù)據(jù)類型,從而是科學(xué)家可以利用新的測序技術(shù),并最大限度地利用舊數(shù)據(jù)集的價(jià)值。
系統(tǒng)發(fā)育學(xué)家可以使用最佳的同行評審算法來比對序列和構(gòu)建樹。可以在實(shí)驗(yàn)室工作之前設(shè)計(jì)克隆策略。可以注釋基因組,并使用功能強(qiáng)大的工具檢測變異。序列可以輕松對齊和組裝。
Geneious Prime是教學(xué)許多學(xué)科基礎(chǔ)知識的絕佳工具,因?yàn)樗鼮閷W(xué)習(xí)者提供了直觀的接觸點(diǎn)。

Geneious Prime特色

1、NGS預(yù)處理
導(dǎo)入Illumina,PacBio和NanoPore讀取
修剪,過濾和解復(fù)用單端和成對端數(shù)據(jù)
合并配對的讀
重復(fù)數(shù)據(jù)刪除
錯(cuò)誤糾正和規(guī)范化
濾除嵌合體
學(xué)到更多
2、制圖和重新組裝
只需在業(yè)界領(lǐng)先的制圖算法和從頭組裝算法之間切換
支持匯編Sanger和NGS數(shù)據(jù),包括任何長度的Illumina,PacBio和Oxford納米孔讀取,包括雙端讀取和混合裝配
組裝微生物基因組,質(zhì)粒和其他環(huán)狀序列時(shí)產(chǎn)生環(huán)狀重疊群
基因組比較和MAUVE基因組比對結(jié)束
映射程序包括BBMap,Minimap2,Bowtie2和TopHat
從頭組裝算法,包括SPAdes,F(xiàn)lye,MIRA,Tadpole和Velvet
3、變體調(diào)用和表達(dá)分析
使用FreeBayes調(diào)用SNP /變體
使用同步的基因組視圖對表格結(jié)果進(jìn)行實(shí)時(shí)過濾
在映射的RNA-seq數(shù)據(jù)上計(jì)算和比較表達(dá)水平
使用PCA和火山圖進(jìn)行可視化
4、序列分析
修剪,組裝和查看Sanger測序跟蹤文件
更正基礎(chǔ)調(diào)用并創(chuàng)建共識序列
注釋主題,ORF和重復(fù)
預(yù)測基因和結(jié)構(gòu)元素
通過針對數(shù)據(jù)庫的相似性搜索進(jìn)行實(shí)時(shí)注釋
快速翻譯選擇內(nèi)容,或顯示注釋或所選框架的翻譯
動態(tài)圖和統(tǒng)計(jì)信息,用于序列特性,例如pI,分子量,熔點(diǎn),AA組成等
5、序列比對
DNA或蛋白質(zhì)的多重和成對序列比對,包括全基因組比對
與包括Aligner,MUSCLE,MAFFT,Clustal Omega,MAUVE和LastZ在內(nèi)的可信算法保持一致
使用實(shí)時(shí)翻譯和突出顯示查看和編輯路線
6、系統(tǒng)發(fā)育學(xué)
使用Geneious Prime 2021樹構(gòu)建器,MrBayes,PAUP *,PhyML,RAxML等構(gòu)建樹
可視化,編輯和標(biāo)記您的樹
交互式距離矩陣查看器
出版物質(zhì)量出口
7、微衛(wèi)星分析
導(dǎo)入原始ABI跟蹤文件
修剪,預(yù)測和手動調(diào)整峰
Bin進(jìn)入等位基因
產(chǎn)生等位基因調(diào)用的表格輸出
8、分子克隆
查看質(zhì)粒圖譜,自動注釋載體以及帶有注釋的復(fù)制粘貼序列
一步式GoldenGate(IIS類型)和限制克隆
基于同源性的克隆,包括Gibson,GeneArt和In-Fusion
TOPO克隆
克隆操作的父母/后代血統(tǒng)追蹤
密碼子優(yōu)化和反向翻譯
沉默突變分析以發(fā)現(xiàn)潛在的限制性酶切位點(diǎn)
模擬PCR,消化和連接
CRISPR站點(diǎn)查找器
9、底漆設(shè)計(jì)
自動設(shè)計(jì)針對任何目標(biāo)區(qū)域或整個(gè)序列的PCR和測序引物以及雜交探針
在序列視圖中輕松添加引物
設(shè)計(jì)基本和簡并PCR引物
在設(shè)計(jì)過程之前,之中或之后添加和刪除引物序列的延伸
引物特異性測試,以檢查模板序列上是否有其他結(jié)合位點(diǎn)
篩選物理性質(zhì),發(fā)夾和引物二聚體
以FASTA,電子表格或GenBank格式拖放引物
10、數(shù)據(jù)管理與協(xié)作
拖放導(dǎo)入文件和文件夾,包括 Vector NTI數(shù)據(jù)庫
將電子表格中的元數(shù)據(jù)導(dǎo)入序列和其他文檔
智能NGS導(dǎo)入–一步導(dǎo)入任何種類的SAM,BAM,GFF,BED和VCF文件
直觀的基于文件夾的項(xiàng)目組織
無縫集成共享數(shù)據(jù)庫
快速搜索數(shù)據(jù)庫中的所有序列和元數(shù)據(jù)
廣泛的出口選擇
11、搜索和爆炸
直接訪問NCBI公共BLAST數(shù)據(jù)庫
私人本地?cái)?shù)據(jù)庫的自定義BLAST
集成搜索外部數(shù)據(jù)庫,包括GenBank和UniProt
將序列直接上傳到GenBank
在PubMed中搜索文獻(xiàn)
針對本地或共享數(shù)據(jù)庫的高級搜索
12、工作流程
使用可視化編輯器創(chuàng)建用于自動化批量分析的工作流
超過20種內(nèi)置工作流,用于執(zhí)行管道,包括將變體應(yīng)用于參考序列,圖譜讀取然后查找SNP和隨機(jī)采樣序列
通過編寫自定義代碼工作流的選項(xiàng)擴(kuò)展功能
13、API和開發(fā)人員
使用插件開發(fā)套件添加特殊功能或與其他系統(tǒng)集成
添加您喜歡的算法,數(shù)據(jù)庫或可視化

Geneious Prime 2021破解版安裝教程

1、首先從本站下載數(shù)據(jù)包然后解壓,得到安裝程序“Geneious_Prime_win64_with_jre.msi”,鼠標(biāo)雙擊運(yùn)行進(jìn)入安裝向?qū)c(diǎn)擊“next”進(jìn)入下一步

2、選擇第一項(xiàng)“I accept the terms of the license agreement”(我接受許可協(xié)議的條款),再點(diǎn)擊“next”進(jìn)入下一步|

3、選擇安裝位置,默認(rèn)路徑為“C:\Program Files\Geneious Prime\”,建議最好不要安裝到系統(tǒng)盤(C盤)

4、勾選“create a dessktop icon”(創(chuàng)建一個(gè)桌面圖標(biāo))

5、軟件安裝需要一些時(shí)間請耐心等待即可

6、當(dāng)安裝完成后點(diǎn)擊“finish”即可退出安裝向?qū)?br />
7、安裝完成后先不要運(yùn)行,回到剛才下載的數(shù)據(jù)包中將破解補(bǔ)丁復(fù)制道軟件的安裝目錄中替換原文件即可

8、最后軟件軟件即可開始免費(fèi)使用,破解完成

Geneious Prime幫助

一、RNA/DNA二級結(jié)構(gòu)折疊查看器
1、默認(rèn)情況下,當(dāng)選擇寡序列中僅示出這個(gè)瀏覽器。如果要在非寡核苷酸序列上使用RNA折疊,請轉(zhuǎn)到工具→首選項(xiàng)→外觀和行為,然后啟用顯示所有序列上的顯示DNA/RNA折疊視圖選項(xiàng)。這將顯示任何小于3000 bp序列的標(biāo)簽。如果選擇的序列是DNA,則選項(xiàng)卡將標(biāo)記為DNA Fold,如果是RNA,則將標(biāo)記為RNA Fold。
2、折疊預(yù)測由Vienna package RNAfold工具執(zhí)行。
使用“查看選項(xiàng)”,可以打開/打開和著色基礎(chǔ),翻轉(zhuǎn)坐標(biāo),突出顯示序列的開始(藍(lán)色)和結(jié)束(紅色)并旋轉(zhuǎn)模型。與其他查看器一樣,您可以放大模型并拖動視圖,或者使用與序列查看器相同的鍵盤修改器使用滾輪。選擇在序列視圖和折疊視圖之間同步。此外,在拆分視圖模式下,折疊查看器在放大時(shí)將滾動到所選區(qū)域。默認(rèn)情況下,將使用“按概率顏色”,其中紅色堿基是堿基在配對區(qū)域中彼此配對或在未配對區(qū)域中不配對的可能性最大的堿基。綠色是中間點(diǎn),藍(lán)色是最低的概率。僅當(dāng)使用分區(qū)功能時(shí),才可以按概率進(jìn)行顏色設(shè)置。更改它們的設(shè)置時(shí),“計(jì)算選項(xiàng)”將重新運(yùn)行RNAfold,因此,根據(jù)序列的大小,可能會有明顯的重新計(jì)算時(shí)間。
二、3D蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)查看器
對于分子結(jié)構(gòu)文檔,例如PDB文檔,這將顯示該結(jié)構(gòu)的交互式三維視圖。
1、結(jié)構(gòu)視圖操縱
單擊并拖動鼠標(biāo)以旋轉(zhuǎn)結(jié)構(gòu)。
按住Alt或Shift鍵,然后單擊并拖動以放大/縮小
按住Ctrl鍵,然后右鍵單擊并拖動以進(jìn)行平移;如果使用Mac,請按住并按住Ctrl鍵和Alt / Option,然后拖動以進(jìn)行平移。
2、選擇控件
結(jié)構(gòu)右側(cè)是控件,可讓您控制結(jié)構(gòu)的選定部分。
如果您正在查看的結(jié)構(gòu)包含多個(gè)模型,則可以在模型組合框中進(jìn)行選擇。
選擇按鈕使您可以選擇結(jié)構(gòu)的全部,無選擇或未選擇的區(qū)域,以及按元素,組類型或輔助結(jié)構(gòu)選擇。
突出顯示選中的復(fù)選框可讓您選擇是否在結(jié)構(gòu)視圖中突出顯示選定的原子。
結(jié)構(gòu)樹以樹格式顯示結(jié)構(gòu)中的原子。單擊樹中的區(qū)域以選擇那些區(qū)域。您也可以按住Shift鍵和Ctrl鍵單擊一次以選擇多個(gè)區(qū)域。
該命令框使您可以鍵入任意的jmol腳本命令。要查看一些示例,請?jiān)诳虻南吕藛沃羞x擇一個(gè)預(yù)先填充的選項(xiàng)。
3、顯示菜單
查看器頂部是顯示菜單。您可以在此處修改結(jié)構(gòu)的外觀。
“重置”使您可以重置結(jié)構(gòu)的位置,將結(jié)構(gòu)的外觀重置為默認(rèn)外觀,或者將結(jié)構(gòu)的外觀重置為其上次保存時(shí)的外觀。
顏色使您可以更改原子所選區(qū)域的配色方案。
樣式可讓您將分子所選區(qū)域的樣式更改為例如空格或卡通視圖。
原子使您可以隱藏原子或更改分子在選定區(qū)域中的大小。您還可以選擇是否顯示氫原子和原子符號。
鍵使您可以隱藏鍵或在分子的選定區(qū)域中更改鍵的大小。共價(jià)鍵/離子鍵,氫鍵和二硫鍵可分別受影響。
“效果”使您可以切換整個(gè)分子的自旋,抗鋸齒,立體和平板效果。
保存可保存分子的當(dāng)前外觀。
三、查看,編輯和提取注釋
1、注釋用于描述和可視化序列和比對中的特征,例如編碼區(qū)域,限制位點(diǎn)和重復(fù)元件。 注釋可以直接在序列查看器中的序列上注釋,也可以在邏輯上分為軌道。 軌道是一個(gè)或多個(gè)注釋類型的集合。 軌道垂直堆疊在所討論的序列下方,每個(gè)軌道及其注釋都有單獨(dú)的一行。
2、批注可能具有一個(gè)或多個(gè)與之關(guān)聯(lián)的屬性或限定符。 這些可以在創(chuàng)建注釋時(shí)添加,也可以在以后通過編輯注釋添加。 要查看給定注釋的屬性,請將鼠標(biāo)放在序列查看器中。 這將顯示一個(gè)工具提示,列出該批注的名稱,類型,長度,間隔和順序以及任何其他限定符,通過將鼠標(biāo)懸停在注釋上來顯示注釋屬性和限定符
四、填充注釋
Geneious Prime 2021具有許多為序列添加注釋的功能。 它們可以手動添加,從外部來源導(dǎo)入,從其他序列轉(zhuǎn)移或作為結(jié)構(gòu)或基因預(yù)測步驟的一部分添加。

Geneious Prime 2021新功能

1、剖析CRISPR編寫結(jié)論
輕輕松松兩端對齊,聚類算法和數(shù)據(jù)可視化CRISPR編寫試驗(yàn)里的NGS讀值。根據(jù)您選擇的應(yīng)用程序(包含HDR,NHEJ與基礎(chǔ)在線編輯器)剖析組合的次數(shù)以及蛋白質(zhì)效用。
2、加強(qiáng)型檢索選擇項(xiàng)
通過一個(gè)統(tǒng)一的頁面桌面搜索你的文本文檔,文件夾名稱,分析工具和近期查詢項(xiàng)目。
3、密碼子優(yōu)化和反方向漢語翻譯改善
2020.2–將鼠標(biāo)懸停在優(yōu)化密碼子上,以獲得相關(guān)同義詞密碼子以及工作頻率更深層次的信息。
2020.1–為實(shí)體模型微生物訂制密碼子優(yōu)化主要參數(shù)。
2020年–一個(gè)全新的密碼子優(yōu)化優(yōu)化算法使大家可以通過從蛋白或核糖核苷酸序列逐漸形成新序列,來配對選定生物體的密碼子使用方法。
4、剖析CRISPR編寫過程的工具
從CRISPR編寫試驗(yàn)的結(jié)論中核對NGS測序并使之聚類算法
適用各種各樣應(yīng)用軟件,包含HDR,NHEJ與方法在線編輯器
數(shù)據(jù)可視化與未基因突變參照序列相提并論組合
剖析組合的次數(shù)以及蛋白質(zhì)效用
5、強(qiáng)化的搜索欄
應(yīng)用文字查看從單獨(dú)統(tǒng)一頁面實(shí)時(shí)搜索文件夾名稱和文本文檔
檢索GeneiousPrime中可利用的分析工具(實(shí)際操作)的新功能
輕輕松松瀏覽別的高級檢索選擇項(xiàng)
桌面搜索近期查詢的文件夾名稱和文本文檔
6、密碼子優(yōu)化改善
相關(guān)優(yōu)化密碼子注解的信息工具提示可以從選定密碼子應(yīng)用表格中提供相關(guān)同義詞密碼子以及信號頻率信息
如今,在經(jīng)過挑選注解優(yōu)化挑選的地區(qū)時(shí),將考慮到包含專一性和CDScodon_start信息等在內(nèi)的注解特性
應(yīng)以好幾個(gè)間距優(yōu)化選中注解時(shí),跨間距優(yōu)化挑選,而且容許密碼子超越鄰近間距
當(dāng)優(yōu)化反方向挑選地區(qū)時(shí),反方向相輔相成序列現(xiàn)在已經(jīng)優(yōu)化

以上便是KKX小編給大家分享介紹的Geneious Prime 2021免激活破解版!

Geneious Prime 2021 v2021.1.1激活版

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